بیماری کاوازاکی یک «واسکولیت سیستمیک» حاد است، به این معنی که التهاب در دیواره رگ‌های خونی میتواند منجر به گشاد شدن (انوریسم) هریک از شریان با اندازه متوسط در بدن، به ویژه شریان‌های کرونر گردد.در عین حال، بیشتر کودکان تنها علایم سیستمیک را بدون اینکه عوارض قلبی پیدا کنند نشان می‌دهند.