امروز کسی تردید ندارد استاد سید محمدحسین طباطبایی از جمله متفکرانی است که در پیشرفت و تحول علم الهیات نقش بسزایی داشته‌ است تا آنجا که جایگاه الهیات در نتیجه تلاش‌های ایشان در مقایسه با سایر کشورهای اسلامی همسایه برتری خاصی یافته‌ است.