یکی از مشکلات آیین‌نامه ارتقاء اساتید این است که باید مقالات در مجلات معتبر نمایه شوند، دانشگاه‌های مختلف نیز شرط می‌گذارند که آن‌‎ها باید به عنوان مثال isi باشند، خب این موضوع درست نیست، زیرا در این صورت تفاوتی میان خدمات دانش‌بنیانی که در سطح کشور گره‌گشایی می‌کنند با مقالات دیده نمی‌شود. آیین‌نامه ارتقاء اساتید هنوز به میزانی منعطف نشده است که یک عضو هیئت علمی بتواند به عنوان مثال با آموزش ارتقاء پیدا کند، آیین‌نامه چهار بند فرهنگی، آموزشی، پژوهشی، فرهنگی دارد، مسلما باید به گونه‌ای باشد که اگر یک استاد پایه اصلیش معلم خوب بودن است نیز بر اساس همین موضوع ارتقاء یابد.

اعتراض بسیاری از کارشناسان به آیین‌نامه ارتقای اساتید ما را بر آن داشت تا به گفتگو با یکی از پراستنادترین دانشمندان ایرانی بپردازیم و از چالش‌های ایجاد شده آگاه شویم.

استادیار دانشکده گفت: همیشه قانون غلط بدتر از بی‌قانونی است، وقتی رتبه افراد به تعداد کتاب یا مقالات تألیف شده آن‌ها ختم می‌شود مسلماً شما با یک شخص مقاله ساز و کتاب ساز روبه‌رو خواهید شد به‌نحوی‌که آن را به‌سوی کمیت سوق داده‌اید نه کیفیت.

دبیر شورای عالی انقلاب فرهنگی گفت: شورای عالی انقلاب فرهنگی قبل از سال ۹۹ مصوب کرده است تا آیین نامه ارتقای اعضای هیئت علمی از انحصار نظام‌های رتبه‌بندی خاص خارج شود.

رئیس دانشگاه تهران با تاکید بر اینکه دانشگاه ها خود آیین نامه ارتقای اساتید را تدوین کنند، از شیوه تدوین متمرکز آیین‌نامه ارتقاء اساتید برای همه دانشگاه‌ها انتقاد کرد.