نقش مرجعیت دینی و نفوذ آیت‌الله سیستانی باعث یکپارچگی عراق در برابر توطئه‌ها و تجزیه‌خواهی این کشور شده و فتوای موثر ایشان در امر شرکت در جهاد بود که توانست مردم عراق را، اعم از شیعه و اهل سنت، برای مبارزه با داعش فراخواند وعرصه را بر گروههای تکفیری در عراق تنگ نماید.