دادستان کل اول انقلاب گفت: بنده معتقدم ترور شهید فخری‌زاده تنها به دلیل نفوذی‌ها صورت گرفته و‌گرنه انجام یک عملیات تروریستی در درون خاک ایران با این همه دقت و استفاده از تکنولوژی‌های پیشرفته دنیا امکان‌پذیر نیست. در این مسأله شکی وجود ندارد که عوامل اصلی این ترور آمریکا و اسرائیل هستند و این کشور‌ها در پشت پرده از تروریست‌ها علیه ایران استفاده می‌کنند. با این وجود عده‌ای، جاده صاف‌کن بوده‌اند و زمینه این ترور را فراهم کرده‌اند. این نفوذی‌ها شرایطی را به وجود آورده‌اند که یک دانشمند برجسته علمی کشور ترور شود.