در بیانات مقام معظم رهبري، مد ظله‎‌العالی در مراسم تنفیذ حکم سیزدهمین دوره ریاست جمهوری اسلامی ایران، رهنمودهای وجود داشت که انجمن‎‌های علمی، اتحادیه‌های انجمن‎‌های علمی، و شورای انجمن‌های علمی ایران، با تکیه بر استعداد و سازوکارهای قابل دسترس خود، می‌‎توانند کمک‌های بسیاری را در راستای تحقق آن‌ها داشته باشند. ذیلاً، در حد فهم نویسنده، به برخی از آن‌ها اشاره شده‌‎است. امیدوار است همکاران محترم در انجمن‌ها، اتحادیه‌ها و شورا هم نسبت به تکمیل این راهکارها کمک کرده، و هم قدم‌‏های اثربخشی را در راستای تحقق رهنمودهای معظم له بردارند. لازم به توضیح است که موارد مورد نظر در سخنان مقام معظم رهبری، در قالب پی نوشت، مورد واکاوی نویسنده قرار گرفته است.

یکی از نقد‌های وارده بر دانشگاه‌های نسل اول و دوم (آموزشی و پژوهشی)، عدم مشارکت فعال آن‌ها در پروژه‌های بزرگ اجرایی با رویکرد‌های علمی-پژوهشی و در پیش گیری نوعی انفعال و عدم حساسیت است. این رفتار دلایل مختلفی می‌تواند داشته باشد و یکی از مهمترین این دلایل را می‌بایست در کم توجهی به تعریف ساختار‌های مناسب تعریف پروژه‌های تحقیقاتی و شکست کار متناسب با آن دانست.