آیت الله مصباح یزدی از نظر تئوری سیاسی، به شدت منتقد احزاب بود و ساختار فکری و عملی او بیشتر بر اطاعت تمرکز داشت تا انجام مباحثات حزبی، با این‌حال در تناقضی عجیب همزمان به پرورش و آموزش نیرو‌های همفکر اصرار داشت و به شدت از جبهه پایداری به عنوان یکی تشکل‌های سیاسی اصولگرا حمایت می‌کرد. او همچنین مدرسه امام خمینی قم را برای پرورش طلاب تاسیس کرد که یکی از مراکز مهم تولید مدیر برای جمهوری اسلامی به شمار می‌رود.