بخش زیادی از دلسوزان نظام بر شیوه فعالیت شورای نگهبان نقد دارند. شهید مطهری در این خصوص معتقد است که حتی از روی مصلحت هم نباید آزادی مردم را محدود نمود. این انتقاد به معنای نادیده گرفتن اهمیت و جایگاه و ضرورت فعالیتی شورای نگهبان نیست، بلکه تضارب آرایی برای تقویت شورا است.