در اندیشه آیت‌الله سیستانی، شریعت تفصیل عقل است. بنا بر این نقش پیامبران را پنددهی، یادآوری و همچنین زدودن غبار از فطرت انسان دانسته و شرایع را نیز تبیین کننده قانون فطری می‌داند. قانونی که حقوق‌دانان آن را قانون طبیعی نامیده‌اند و آیت‌الله سیستانی به آن «قانون فطری» می‌گوید.