آیت‌الله محمد یزدی، دبیرکل جامعه مدرسین حوزه علمیه قم، از اساتید حوزه علمیه که بر استقلال حوزه تأکید و طلاب را از ارتباط با نظام نهی می‌کنند، انتقاد کرد و گفت: «استقلال حوزه این نیست که انسان از حکومت جدا بشود و فاصله بگیرد و بگوید من کاری به کار حکومت ندارم.»