پیش از حضور آقای دکتر ولایتی به عنوان رئیس هیئت امنای دانشگاه آزاد اسلامی و در زمان مرحوم آیت‌الله هاشمی‌رفسنجانی، در مواقع بحرانی و حساس هجمه‌ها عمدتا به سمت دکتر جاسبی مدیریت وقت دانشگاه آزاد متمرکز می‌شد. البته صرفا در ایام انتخابات و بهره‌برداری‌های سیاسی نیز انتقادات به دانشگاه آزاد که عمدتا مباحث مربوط به شهریه بود دستاویزی‌ شده بود برای نقد عملکرد دوران حضرت آیت‌الله هاشمی‌رفسنجانی. اما تفاوت در دوره جدید آن است که آقای دکتر ولایتی بیشتر در امور اجرائی دانشگاه آزاد اسلامی ورود می‌کند و حضور پررنگ رسانه‌ای ایشان در این مدت هم، آسیب‌هایی را در جریان واژگونی اتوبوس دانشگاه آزاد واحد علوم و تحقیقات تهران از سوی مردم و نگاه کاربران فضای مجازی متوجه ایشان کرد.