علي مطهري در اظهارنظري در برنامه اينترنتي «رودررو» گفته نهضت آزادی ایران یک‌ گروه باسابقه اسلامی است؛ فکر نمی‌کنم نامه منسوب به امام درباره نهضت آزادی، واقعا از امام باشد». او همچنين نامه امام درباره آيت‌الله منتظري را محل ترديد قرار داده است.