محصولات تراریخته از نظر مفهومی با آمیزش طبیعی گیاهان تفاوت دارد و استفاده از آن‌ها موجب ریسک‌های متفاوتی می‌شود. مطالعات زیادی در زمینه آثار محیط‌زیستی و سلامت محصولات کشاورزی تراریخته انجام شده است و نتیجه این مطالعات منجر به تصمیم 21 دولت به عدم کاشت این محصولات و بعضاً استفاده محدود از این محصولات در کشور‌شان شده است.