انتقاداتی چند بر نحوه فعالیت ستاد اجرایی وارد بوده و هست. اما بدلیل ماهیت این نهاد، کمتر مورد توجه و نقد قرار گرفته است. بعنوان مثال مجموعه مخابرات و انتقادات وسیعی که مردم از عملکرد آن داشته و دارند. بازنشسته‌های شرکت مخابرات مقابل ستاد اجرایی فرمان امام تجمع نموده و خواستار رسیدگی به وضعیت خود هستند. اما حاشیه این تجمع نیز جالب بود. برخورد خوب یگان انتظامی و البته ادعای مبهم غیرقانونی بودن این تجمع؟