سید علی خمینی گفت: در شرایط فعلی هر سیاست یا اقدام یا قانونی که موجب تقویت شکاف‌های اجتماعی شود، مشکوک و ممنوع است.وی با ابراز تاسف از عدم کار علمی عمیق، بر روی مبانی نظری اندیشه‌های بنیانگذار جمهوری اسلامی ایران افزود: متأسفانه بسیاری از مضامینی که امام عرضه داشتند، هنوز بسط نظری پیدا نکرده. برای مثال، هنوز در مورد چگونگی همجواری دو مفهوم اسلام و جمهوریت و مفاهیمی، چون مصلحت و وحدت و بسیاری از کلیدواژه‌های مهمی که امام بیان داشتند، کار مهمی صورت نگرفته است.