۲۷ آذر ۱۳۵۸، مفتح توسط گروه فرقان به شهادت رسید و این روز بنام وحدت حوزه و دانشگاه نامگذاری شد. اما قبل از شهادت مفتح، زمزمه‌های زیادی از وجود اختلاف بین مفتح و بهشتی مطرح شده بود. در جریان انتخابات مجلس خبرگان قانون اساسی، از تهران ۱۵ نفر حق انتخاب شدن داشتند و در جلسات جامعه روحانیت مبارز و گروه‌های خط امام، بنا شد که شهید مفتح از تهران به عنوان نامزد معرفی شوند، اما در جلسات بعد به این نتیجه رسیدند افرادی که معروف‌تر هستند و در کسب آرا، موفق‌تر خواهند بود، از تهران معرفی و سایرین از بقیه استان‌ها نامزد شوند. از جمله قرار شد شهید مفتح از استان همدان نامزد شوند. درست از لحظه‌ای که این تصمیم گرفته شد، تلفن‌ها و رفت و آمد‌های افرادی خاص شروع شد و به آقای مفتح القا کردند که، «آقا! دیدید شما را کنار زدند. شما باید از تهران نامزد می‌شدید، نه از همدان. دیدید آقای بهشتی شما را کنار زد؟» و .... محمد پیشگاهی فرد که خواهرزاده همسر شهید بهشتی است و بعد‌ها داماد شهید مفتح شد و از نزدیک با ایشان مراوده و حشر و نشر داشت، در گفت و گویی که با نشریه شاهد یاران، شماره چهارده انجام داده، درباره اصل و ریشه این اختلافات و واقعی و غیر واقعی بودن آنها، صحبت می‌کند.