انتقاداتی چند بر نحوه فعالیت ستاد اجرایی وارد بوده و هست. اما بدلیل ماهیت این نهاد، کمتر مورد توجه و نقد قرار گرفته است. بعنوان مثال مجموعه مخابرات و انتقادات وسیعی که مردم از عملکرد آن داشته و دارند. بازنشسته‌های شرکت مخابرات مقابل ستاد اجرایی فرمان امام تجمع نموده و خواستار رسیدگی به وضعیت خود هستند. اما حاشیه این تجمع نیز جالب بود. برخورد خوب یگان انتظامی و البته ادعای مبهم غیرقانونی بودن این تجمع؟

مدیرعامل اسبق شرکت مخابرات با اعلام نکاتی از قرارداد معامله ۷.۸ هزار میلیارد تومانی گفت: فسخ قرارداد بلوک ۵۰ درصدی مخابرات به دلیل عدم پرداخت یک قسط از ۱۶ قسط آن هم درحالی که فقط ۳ قسط باقی مانده امکان پذیر نیست.