برخی فارغ‌التحصیلان دانشگاه آزاد برای استعلام مدرکشان بین دو نهاد وزارت علوم و دانشگاه آزاد سرگردانند، این در حالی است که وزیر علوم مسئولیت اشتباه نظارتی وزارت علوم و اشتباه اجرایی دانشگاه آزاد را برعهده نمی‌گیرد.