استاد مسجدجامعی با بیان اهمیت الهیات عملی در عین حال اذعان می‌کند که پایه گذاران آن با مشکلاتی مواجه هستند. او می‌گوید: توقع ما از دین باید با منطق آن دین هماهنگ باشد. در این صورت است که پاسخ ما مورد قبول قاطبه متدینین قرار می‌گیرد و اصولا ادامه می‌یابد. در مورد مسیحیت کاتولیک این مشکل خیلی کمتر وجود دارد، زیرا دین آن‌ها متن‌مدار نیست بلکه اجماع‌مدار است و آنچه که اجماع مومنین به آن می‌رسد، مهم است.

محمد مسجدجامعی می‌گوید: گرایش مثبت ایجاد شده، جهت ترمیم و گسترش رابطه با ایران غنیمت است.

محمد مسجدجامعی چشم‌انداز عربستان سعودی این کشور را مورد بررسی قرار داده است.