برخی کج فهمی ها از مفهوم بومی سازی علوم انسانی سبب شده بخش مهمی از دانش بشری به عنوان تجربه ی مشترک و متعلق به جامعه ی انسانی حذف و نادیده انگاشته شود.

بحث ما کارکردهای علم مدرن است. مفهوم کارکردها و تأثیر آن در جوامع مدرن، مختص علوم اجتماعی نیست بلکه کل علوم در این قضیه نقش دارد. جهان مدرن با یک علم شکل نگرفته و همه علوم در شکل‌دهی به آن نقش دارند، ‌وقتی تمدنی بدون تقدم و تأخر متحول می‌شود، آنچه به دنبال آن اتفاق می‌افتد تمام علوم دگرگون می‌شود و آن چرخشی که منشأ شکل‌گیری دنیای متفاوت می‌شود اختصاص به یک جا ندارد.

روش های متناسب با تولید علوم انسانی اسلامی لزوما تاسیسی نیستند بلکه باید به میراث اسلامی و فرهنگی خودمان بازگردیم تا ظرفیت های برجسته ای که امکان بازسازی آنها برای روش است را پیدا کنیم.