اکنون مديريت منابع آب در ايران کاملا پيچيده و چندوجهي شده است؛ چون تحت تأثير عوامل مختلف و پوياي اقتصادي، اجتماعي، فرهنگي و سياسي است و سياست‌ها، دستگاه‌ها و نهاد‌هاي مختلفي در آن مؤثر هستند. اين عوامل در کنار رشد فزاينده مراکز جمعيتي، صنعتي و کشاورزي، کاهش منابع آب تجديدپذير و افزايش تقاضا براي آب و رقابت براي دسترسي به آن، مديريت بهينه منابع آب را با چالش‌هاي جدي روبه‌رو کرده است.