با وجود ثبت ملی کوهستان شاهوار شاهرود ، فعالیت معدن مخرب بوکسیت در این منطقه، باعث تخریب گسترده منابع طبیعی، پوشش گیاهی و زیستگاه جانوری، منابع آبی شاهرود شده است. نامه شماره ۹۸۷۹۵۳ اداره کل منابع طبیعی استان سمنان مورخ ۱۱ تیرماه ۹۸ اشاره دارد که شرکت بوکسیت تاش بدون اخذ مجوزهای لازم و قانونی اقدام به تخریب و تصرف عدوانی مساحت ۱۶۵ هزار و ۲۲۰ مترمربع اراضی ملی در پلاک ۱۱ بخش اصلی ۱۰ ثبتی شهرستان شاهرود موسوم به تاشین کرده و به جهت ایجاد مسیر دسترسی به معدن اقدام به احداث مسیری به طول هفت هزار و ۲۹۰ متر و عرض ۱۲ متر نموده است، لذا با بررسی‌های صورت گرفته مشخص گردیده که مسیر احداث شده نسبت به صورت وضعیت تنظیمی از سوی منابع طبیعی کاملاً تفاوت و جابجا شده است . آیت الله حسن نظری شاهرودی، امام جمعه اسبق شاهرود، از جمله کسانی است که بازگشایی معدن بوکسیت شاهوار را دارای اشکال جدی می‌داند. در نامه اخیر سازمان محیط زیست به دفتر معاون اول رئیس جمهور صراحتاً با معدن کاوی در شاهوار مخالفت شده است .

سنگ معدن بوکسیت به‌صورت پراکنده در کوه وجود دارد و برای بهره‌برداری باید تمام این کوه با انفجار برداشته شود و تخریب سنگ معدن مخزن آب را با هیچ پولی نمی‌توان جبران کرد. ایجاد جاده‌های معدنی برای دسترسی کامیون‌ها به ماده معدنی تخریب وسیع دامنه‌های شاهوار را سبب شده است. تردد وسیع کامیون‌های حمل مواد معدنی در جاده‌های خاکی معدن از دیگر عوامل تولید غبار و آلودگی هوا در ناحیه است.