در بسیاری از کشور‌های جهان نیز طرح پزشک خانواده درحال اجراست و بسیاری از مردم از مزایای اجرای این طرح بهره‌مند می‌شوند، در این طرح بیمار در ابتدا به پزشک خانواده مراجعه و اگر نیازمند درمان‌های تخصصی بود، توسط پزشک خانواده به پزشک متخصص و فوق‌تخصص ارجاع داده می‌شود. امروز پس از چندسال از اجرایی شدن این طرح، آن‌گونه که پیداست طرح پزشک خانواده با اشکالات و ابهامات اساسی روبه‌رو شده است و نهال کاشته‌شده پزشک خانواده در دهه ۸۰ حالا نیاز به هرس دارد. نکته جالب داستان اینجاست که با مصوبه مجلس، وزارت بهداشت مکلف است نسبت به اجرای برنامه نظام ارجاع و پزشک خانواده در سه سطح یک، دو و سه و با استفاده از تمامی ظرفیت‌های موجود در کشور اعم از دولتی و غیردولتی اقدام نماید. موضوعی که باید بشکل لالایی آنهم بشکلی مکرر در گوش سازمان بازرسی کل کشور بخوانیم تا شاید اقدامی صورت دهد.

وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی گفت: پرونده الکترونیک سلامت بزرگترین ریل برای عبور و اجرای نظام ارجاع و پزشکی خانواده است. همچنین تا دو هفته آینده قابلیت دسترسی افراد به پرونده الکترونیک خودشان از طریق تلفن همراه فراهم می شود.نمکی درباره اجرای نظام ارجاع و پزشکی خانواده در نیمه دوم سال جاری اظهار داشت: یکی از مشکلاتی که در گذشته در وزارت بهداشت وجود داشت، گره زدن پرونده الکترونیک سلامت، نظام ارجاع و پزشکی خانواده به هم بود و این هراس وجود داشت که اگر یکی اجرا نشود، بقیه موارد نیز اجرایی نمی شود.

سرپرست وزارت بهداشت گفت: نظام ارجاع و پزشک خانواده حداکثر تا بهار سال آینده در استان‌های شمالی کشور تکمیل ‏می‌شود و سپس از استان‌های دیگر دعوت می‌کنیم که از این الگوی موفق بازدید کنند و تا پایان سال 98 قسمت عمده‌ای از کشور را ‏تحت پوشش قرار می دهیم.‏

عضو کمیسیون بهداشت و درمان مجلس، از روند اجرای طرح تحول نظام سلامت انتقاد کرد و گفت: این وضعیت باعث کسری اعتبارات حوزه سلامت می شود.