علی رغم تاکید کارشناسان، مسئولان سازمان امور مالیاتی و مرکز پژوهش های مجلس مبنی بر ضرورت حذف معافیت مالیاتی مناطق آزاد ، 105 نفر از نمایندگان مجلس پیشنهاد داده بودند علاوه بر مناطق آزاد، مناطق ویژه اقتصادی هم از پرداخت مالیات بر ارزش افزوده معاف شوند که این پیشنهاد به تصویب نرسید.

معاون مالیات بر ارزش افزوده سازمان امور مالیاتی با اشاره به اینکه هیچ جای دنیا، معافیت‌های مالیاتی مناطق آزاد، مادام‌العمر نیست، گفت: بعد از گذشت 11 سال معافیت مناطق آزاد، وقت آن رسیده تا این قانون، در مناطق آزاد هم اجرا شود.