ساختار درآمدزای انبارداری در بنادر کشور به‌گونه‌ای طراحی شده که منافع برخی دستگاه‌ها و سازمان‌های ذی‌ربط در ماندگاری طولانی‌تر کالاها در انبارها تأمین می‌شود؛ همین موضوع باعث کاهش انگیزه برای تسهیل فرآیند ترخیص و بهینه‌سازی عملکرد بنادر شده است.پس از حادثه انفجار در بندر شهید رجایی و پیامدهای آن، مقامات رسمی کشور، از جمله مسعود پزشکیان رئیس جمهور، به‌طور صریح از شیوه مدیریت بندر انتقاد کردند. پزشکیان در سخنانی تأکید کرد که باید از خود بپرسیم چرا ۱۴۰ هزار کانتینر در بندر نگهداری می‌شوند و چرا این وضعیت به‌عنوان یک «چرخه طبیعی» پذیرفته شده است؟ از سوی دیگر، بروکراسی طولانی و ناکارآمد، از جمله ارزیابی‌های گمرکی و تعیین منشأ ارز نیز به این مشکل دامن می‌زند. در بندر شهید رجایی، فرآیندهای گمرکی پیچیده و ناکارآمد همچنان به شیوه‌های سنتی مانند ارزیابی فیزیکی کالاها وابسته است. این روش‌ها نه‌تنها زمان‌بر هستند، بلکه امکان بروز تخلفاتی مانند گم شدن کالا یا سوءاستفاده از اسناد را نیز افزایش می‌دهند. نتیجه این وضعیت، توقف کالاها در بندر و افزایش هزینه‌های انبارداری است که به‌طور مستقیم به ضرر بازرگانان و اقتصاد کشور تمام می‌شود.

در سال ۱۳۹۸ در مجموع ۱۵۰ میلیون و ۳۸۹ هزار تن کالا در ۱۹ بندر کشور جابه‌جا شده که حدود ۸۲ درصد آن در دو بندر شهید رجایی و امام خمینی (ره) و ۱۸ درصد مابقی نیز از طریق ۱۹ بندر دیگر تخلیه و بارگیری شده است.

معاون برنامه‌ریزی سازمان بنادر و دریانوردی گفت: سازمان بنادر به‌عنوان طلایِه‌دار تجارت بین‌المللی کشور راهکارهایی برای مقابله با تحریم‌ها در دستور کار دارد.آرامی با بیان اینکه در مدیریت اجرایی اصل بر این است که با از دست رفتن یک فرصت، باید به دنبال استفاده از فرصت‌های جدید باشیم، گفت: در شرایط تحریم باید از تمامی ظرفیت‌های سازمان بنادر برای کمک به رونق اقتصادی کشور بهره گرفت.معاون برنامه‌ریزی و توسعه منابع سازمان بنادر و دریانوردی کاهش هزینه‌های جاری را ازجمله راهکارهای عملی برای چابک سازی سازمانی دانست و خاطرنشان کرد: با مدیریت هزینه‌ها می‌توان شرایطی را ایجاد کرد که رسالت سازمان دچار مشکل نشود.

سه روز قبل از دور اول تحریم‌های آمریکایی علیه ایران، قرار است خط کشتی‌رانی هاپاگ‌لوید آلمان، قیمت هر تی‌‌ای‌‌‌‌یو در مسیر شرق دور و خلیج فارس را 300 دلار افزایش دهد. این اتفاق، اثر مهمی بر افزایش قیمت حمل‌ونقل دریایی این خط کشتی‌رانی خواهد داشت. آن‌گونه که کارشناسان تحلیل می‌کنند احتمالا هاپاگ‌لوید، آغازگر چنین جریانی است و دیگر خطوط خارجی که از این منطقه عبور می‌کنند، هم دنباله‌رو این خط کشتی‌رانی، افزایش قیمت را در نظر خواهند گرفت و هم‌اینک نیز صداهایی شنیده می‌شود.

‌مدیرعامل سازمان بنادر کشور نیز در حاشیه بازدید از طرح توسعه بندر چابهار گفت: به زودی با حضور مسئولان عالی‌رتبه کشوری، فاز اول بندر چابهار افتتاح خواهد شد.

نگاهی به آمار تخلیه و بارگیری بنادر نشان می دهد که در خرداد ماه امسال نزدیک به ۱۳ میلیون تن عملیات تخلیه و بارگیری در بنادر کشو انجام شده که نسبت به مدت مشابه سال های ۹۴ و ۹۵ رشد داشته است.

پس از اظهارات محمدمهدی افتخاری، نماینده مردم فومن و شفت در خصوص نبودن توجیه اقتصادی برای احداث بنادر چمخاله و آستارا و پیشنهاد برای تمرکز سرمایه گذاری در بندرانزلی، مهرداد بائوج لاهوتی در گفتگو با خبرنگار خزرآنلاین از اهمیت بنادر کوچک و توجیهات اقتصادی در بنادر آستارا و چمخاله گفت و اظهار داشت: نباید چنین صحبت هایی مطرح شود، ما مدت ها بدنبال این طرح بودیم، بندرچمخاله و بندر آستارا بنادر جدیدی نیستند، آقای افتخاری به دلیل اینکه در جریان مسائل نیستند یک مقدار در صحبت کردن عجله میکنند.